Le directeur Masamichi Yamamoto a ouvert l'école de langue japonaise Kyoto Minsai le 9 octobre 2001, au 2 Nishishichijo Higashiishigetsubocho, dans le quartier Shimogyo de la ville de Kyoto.

En mars 2004, Kyoto Minsai a déménagé dans ses locaux actuels du campus Tenjingawa.

Le 12 juin 2007, Kyoto Minsai est passée d'une entreprise privée à une société anonyme, changeant son nom pour Kyoto Minsai Co., Ltd.

En avril 2009, un cours de formation pour professeurs de japonais a été proposé sur notre campus de Nishioji. Le professeur Fumio Tamamura, professeur émérite à l'université Doshisha, en était le directeur.

De 2001 à 2010, Kyoto Minsai recrutait des étudiants deux fois par an (en avril et en octobre). Depuis 2011, Kyoto Minsai a étendu son recrutement à quatre fois par an (en janvier, avril, juillet et octobre).

Nos étudiants actuels proviennent d'environ 50 pays répartis sur six continents.

Notre capacité d'inscription actuelle approuvée par le ministère de la Justice est de 813 étudiants (approuvée en octobre 2023).

Depuis avril 2025, notre établissement est officiellement certifié à la fois comme établissement de formation pratique agréé et comme établissement de formation agréé pour les enseignants de japonais.

À compter de la rentrée d'octobre 2025, Kyoto Minsai est devenue un établissement agréé par le ministère de l'Éducation, de la Culture, des Sports, des Sciences et de la Technologie (MEXT) et propose trois cursus : un cursus académique, un cursus Business et communication, et un cursus de langue et culture japonaises.