山本正道校長於 2001 年 10 月 9 日，在京都市下京區西七條東石ケ坪町 2 號，創立京都民際日本語學校。

2004 年 3 月，學校遷移至現今的天神川校園（京都市右京區西京極北大入町 69 號）。

2007 年 6 月 12 日，由個人經營轉為公司法人，並更名為株式會社京都民際。

2009 年 4 月，開設日語教師培訓課程，並邀請已故玉村文朗先生（同志社大學名譽教授）擔任課程負責人，於本校西大路校開課。

2001 年至 2010 年期間，每年進行兩次學生招生（4 月生、10 月生）。自 2011 年起，改為每年四次招生（1 月生、4 月生、7 月生、10 月生）。

目前在校學生來自五大洲共 50 個國家。

目前經日本法務省核准之招生名額為 813 名（2023 年 10 月核准）。

2025 年 4 月，本校日語教師培訓課程取得「登錄實踐研修機構」及「登錄日本語教育養成機構」之認可。

自 2025 年 10 月生起，取得文部科學省認定教育機構資格，並正式開設升學課程、就業課程、日本語・文化課程三大課程。